Curso Bioinformática

El curso se llevó a cabo por profesionales con amplio conocimiento en el campo. Los principales objetivos de esta actividad son:

  • Introducir a nivel teórico las distintas ómicas y sus características. Genómica (Metagenómica), Epigenómica, Transcriptómica, Proteómica, Metabolómica. Presentar los análisis relacionados con cada ómica.
  • Introducir las bases de la programación en Python.
  • Presentar el esquema general de análisis de datos en RNA-Seq, y cómo se extrapola a otras ómicas. Mención especial de casos en otras ómicas (genómica).
  • Presentar las distintas opciones de análisis tras la generación de la tabla de datos: análisis exploratorios, análisis de expresión diferencial, análisis funcional, machine learning, Biología de Sistemas.
  • Wrap-up: Presentar tendencias actuales en el sector y sus nuevas posibilidades. Recomendar recursos online para la formación en bioinformática, estadística y machine learning.

En las diferentes sesiones, se trataron temas como:

  • Ciencias ómicas y su importancia.
  • Secuenciación y RNA Seq.
  • Programación con Python.
  • Procesado de datos de RNAseq: Formatos FASTA, FASTQ, GTF, Mapeos genéticos.
  • Análisis exploratorio: PCA y bioplots, análisis de expresión diferencial, bases de datos de rutas metabólicas como KEGG.
  • Análisis post-procesamiento.
  • Biología de sistemas.

Fecha: 23 y 24 de abril.
Participantes / ponentes: 

  • Rodrigo García Valiente.
  • Jonatan Fernández García.