El curso se llevó a cabo por profesionales con amplio conocimiento en el campo. Los principales objetivos de esta actividad son:
- Introducir a nivel teórico las distintas ómicas y sus características. Genómica (Metagenómica), Epigenómica, Transcriptómica, Proteómica, Metabolómica. Presentar los análisis relacionados con cada ómica.
- Introducir las bases de la programación en Python.
- Presentar el esquema general de análisis de datos en RNA-Seq, y cómo se extrapola a otras ómicas. Mención especial de casos en otras ómicas (genómica).
- Presentar las distintas opciones de análisis tras la generación de la tabla de datos: análisis exploratorios, análisis de expresión diferencial, análisis funcional, machine learning, Biología de Sistemas.
- Wrap-up: Presentar tendencias actuales en el sector y sus nuevas posibilidades. Recomendar recursos online para la formación en bioinformática, estadística y machine learning.
En las diferentes sesiones, se trataron temas como:
- Ciencias ómicas y su importancia.
- Secuenciación y RNA Seq.
- Programación con Python.
- Procesado de datos de RNAseq: Formatos FASTA, FASTQ, GTF, Mapeos genéticos.
- Análisis exploratorio: PCA y bioplots, análisis de expresión diferencial, bases de datos de rutas metabólicas como KEGG.
- Análisis post-procesamiento.
- Biología de sistemas.
SESIÓN 1
Fecha: 23 y 24 de abril.
Participantes / ponentes:
- Rodrigo García Valiente.
- Jonatan Fernández García.